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                經(jīng)濟(jì)快捷的SNP位點研究方法-SNP基因分型

                發(fā)布時間: 2021-10-11  點擊次數(shù): 1365次

                SNP,全稱 Single Nucleotide Polymorphisms,是指在基因組上單個核苷酸的變異。目前很多人仍然使用測序法來進(jìn)行研究,具有準(zhǔn)確、直觀的優(yōu)點。但有一種方法,能間接的研究SNP,且經(jīng)濟(jì)快捷,那就是——SNP基因分型。


                其實現(xiàn)原理:熔解溫度(melting temperature,Tm)是指吸光值增加到最大值的一半時的溫度稱為DNA的解鏈溫度或熔點。當(dāng)實時熒光定量PCR中的熒光探針與靶基因錯配,即靶基因序列上產(chǎn)生了核苷酸變異,他們的熔解溫度比較低。相對而言,沒有突變的靶基因與探針雜交的熔解溫度較高。通過區(qū)分熔解溫度的差異,來區(qū)分突變型和未突變型(野生型)。


                進(jìn)行SNP基因分型需要注意:

                1、將突變的位點放在探針中間。

                2、保證兩條探針的熔解溫度相同。


                熒光探針中,Taqman探針可進(jìn)行SNP基因分型。推薦Applied Biosystems公司的Taqman MGB探針,相對普通Taqman探針,與錯配序列的熔解溫度相差更大。


                分子信標(biāo)也可用于SNP基因分型。他的莖環(huán)結(jié)構(gòu)比一般線性的分子探針更適合SNP分型,莖環(huán)結(jié)構(gòu)與錯配序列雜交的熱穩(wěn)定性更低,熔解溫度相差也更大。


                讀者們可根據(jù)自己的實驗需求,選擇合適的方法進(jìn)行分析。


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