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                斑點(diǎn)和狹縫雜交

                發(fā)布時(shí)間: 2022-03-24  點(diǎn)擊次數(shù): 1066次

                材料與儀器

                去離子甲酰胺 甲醛(37%) 20XSSC NaOH 預(yù)雜交液
                狹槽 點(diǎn)樣器 真空泵 可燙封塑料袋或雜交管 硝酸纖維 K 膜或尼龍膜 Whatman3MJV1 濾紙

                步驟

                一、材料與設(shè)備

                1) 狹槽

                2) 點(diǎn)樣器

                3) 真空泵

                4) 可燙封塑料袋或雜交管

                5) 硝酸纖維 K 膜或尼龍膜

                6)Whatman3MJV1 濾紙

                7) 去離子甲酰胺

                8) 甲醛(37%)

                9)20XSSC

                10)0.1mol/LNaOH

                11) 預(yù)雜交液:50% 甲酰胺,5XSSC,2XDenhardt, 0.1%SDS,100ug/ml 鮭精 DNA。

                二、操作方法

                (-)樣品處理

                將 l0ulRNA10ug,(RNA 可多至 50ug) 水溶液與下述溶液混合:

                甲酰胺                                                  20ul

                甲醛(37%)                                                     7ul

                20XSSC                                                          2ul

                于 60℃ 溫育 15 min 使其變性,冰浴冷卻樣品。

                (二)點(diǎn)樣

                用 0.lmol/LNaOH 清洗點(diǎn)樣器,再用 DEPC 水充分沖洗。將一張經(jīng) 20XSSC 浸潤的 Whatman3 MM 濾紙鋪在點(diǎn)樣器上,上面鋪張經(jīng) 20XSSC 浸潤 30 min 的硝酸纖維素膜,加蓋并夾緊,接通真空泵。用 10XSSC 清洗各樣孔。在每一 RNA 樣品中加 2 倍體積的 20XSSC,混合后加樣。于外圍幾個(gè)孔中加染料定位,緩慢抽吸,毎孔用 lml10XSSC 淸洗 2 次。繼續(xù)抽吸 5 min,吸干濾膜。

                (三) 固定

                取出濾膜,室溫晾干后,夾在 2 張 Whatman3 MM 濾紙中間,80℃ 干烤 2 h 以固定RNA

                (四)預(yù)雜交

                濾膜烘干后放入可燙封塑料袋 (或雜交管)中,加入 20?30 ml 預(yù)雜交液,密封塑料袋后在 42°C 預(yù)雜交 3 h

                (五)探針制備及標(biāo)記

                參見前面相關(guān)章節(jié)。

                (六)雜交

                將已標(biāo)記的探針煮沸變性 l0 min,取出后立即置冰浴 10 min(單鏈探針不需要變性),將變性探針加入預(yù)雜交液中,密封雜交塑料袋后在 42℃ 雜交過夜。

                (七)洗膜

                雜交結(jié)束后,分別用下列洗液洗膜:

                1)2XSSC,0.5%SDS,室溫洗膜 5 min。

                2)1XSSC,0.1%SDS,42°C 洗膜 30rnin。

                0.1XSSC,0.5%SDS,56℃ 洗膜 30 min。

                (八)檢測

                用 X 射線片進(jìn)行放射性自顯影,附加增感屏,一 70°C 曝光 7?10 天。

                注意事項(xiàng)

                1) 使用快速制備法獲得的細(xì)胞總 RNA 有可能污染基因組 DNA, 因此難以用分光光度計(jì)來精確測定 RNA 含量。此外還必須防止上樣矯作物的出現(xiàn)。對(duì)半定最分析來說,每一樣品須做兩次狹縫印跡,一張膜與所要檢測的 RNA 探針雜交,另一張則與另-種RNA 探針雜交,這種在各個(gè)樣品中的表達(dá)都應(yīng)一樣,或者也可以對(duì)一個(gè)樣品制作-次印跡,但同一張膜必須進(jìn)行兩次重復(fù)雜交。

                2)RNA 樣品在點(diǎn)樣時(shí)要稀釋 8 倍,因此樣品的濃度至少為 10mg/mL

                3) 狹縫雜交很容易出現(xiàn)假陽性性信號(hào)。這可通過以下手段盡可能的避免:①用 Northern 印跡方法嚴(yán)格鑒定探針的特異性;②在所用測試中均需要有適當(dāng)?shù)年幮詫?duì)照;③須非常細(xì)心地制備所用探針、溶液、RNA 等以避免污染。

                以上就是本期的內(nèi)容,更多資訊,歡迎點(diǎn)擊安培生物網(wǎng)站鏈接了解更多技術(shù)與產(chǎn)品資訊

                 

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